Kerjasama Nasional Sebagai institusi pendidikan yang dinamis Universitas Muhammadiyah Maumere selalu berusaha untuk memperluas kerjasama dengan institusi lainnya. Kerjasama pendidikan dan penelitian telah dilakukan dengan berbagai perguruan tinggi dalam negeri (Nasional) seperti:
Sebagai institusi pendidikan yang dinamis Universitas Muhammadiyah Maumere selalu berusaha untuk memperluas kerjasama dengan institusi lainnya. Kerjasama pendidikan dan penelitian telah dilakukan dengan berbagai perguruan tinggi luar negeri (international) seperti : Kerjasama Internasional UP Malaysia-UTP Malaysia-UAD Durakij Pundit University (DPU) Thailand